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新疆教育廳教育工委主要職責是：
（一）加強對教育工作的領導，指導自治區教育系統貫徹執行黨的路線、方針、政策，對教育工作中的重大問題進行調查研究。
（二）指導學校的思想政治工作、政工隊伍建設和精神文明建設。
（三）協助自治區黨委組織部宏觀指導各級各類學校黨建工作，加強高校黨的基層組織和黨員隊伍建設，管理高校領導班子。
（四）指導、監督教育系統紀檢監察工作；指導、協調教育系統統戰、僑務、工會、青年和婦女工作。
（五）指導、協調學校社會治安綜合治理工作。
（六）承辦自治區黨委交辦的其它工作。
自治區教育廳的主要職責是：
（一）全面貫徹執行黨和國家有關教育工作的方針政策和法律法規，擬定自治區教育改革與發展的方針、政策和規劃，起草有關法規規章和管理辦法，并監督實施。
（二）負責各級各類教育的統籌規劃和綜合協調，制定全區教育事業發展規劃和計劃，確定教育事業發展重點、規模、速度和步驟，指導教育教學改革，統計、分析和發布教育基本信息。
（三）綜合管理全區幼兒教育、基礎教育、高等教育、職業教育、成人教育、社會力量辦學等，指導教育體制和辦學體制改革工作。
（四）組織、指導、協調全區各級各類學校（含學前教育機構）“雙語”教學工作。

（五）負責義務教育的宏觀指導與協調，推進義務教育均衡發展，促進教育公平，指導普通高中教育、幼兒教育和特殊教育工作。
（六）統籌指導以就業為導向的職業教育的發展和改革。
（七）統籌指導各類高等教育和繼續教育的發展與改革，落實和擴大高校辦學自主權。
（八）承擔自治區人民政府教育督導團的具體工作，制定自治區教育督導計劃和評估方案，并進行指導、監督、檢查、評估。
（九）參與擬定教育經費籌措、管理和學生資助的方針、政策，負責統計全區教育經費投入情況；指導、協調全區各級各類學校家庭經濟困難學生的資助管理工作。
（十）指導各級各類學校的德育工作、體育衛生藝術教育工作，協助有關部門做好學校國防教育和軍訓工作。
（十一）指導教育系統人才隊伍建設，負責各級各類教師資格認定和繼續教育等工作。
（十二）指導、協調各類教材和教輔用書的編譯、審定和出版工作；配合有關部門做好學校語言文字工作。
（十三）歸口管理全區學歷教育及其考試工作，會同有關部門制定自治區屬高等學校招生計劃，并組織實施。
（十四）參與擬定普通高等學校畢業生就業政策，指導普通高等學校開展大學生就業創業工作。
（十五）規劃、指導教育系統自然科學和哲學社會科學研究，以及科技成果轉化、教育信息化和產學研結合等工作。
（十六）協調內地與新疆、區內教育對口支援工作。
（十七）歸口管理與國外和港澳臺的教育合作與交流，負責審批舉辦國際教育展覽；指導、協調漢語國際推廣工作。
（十八）實施國家學位制度，負責全區學位授予工作。
（十九）指導教育系統各類學會、協會、研究會、基金會等社團組織工作。
（二十）承辦自治區人民政府交辦的其它工作。

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