南大學生在校期間可以申請轉專業。方式如下：

（1）通過開學后不久組織的“拔尖計劃”

（2）通過“專業準入準出標準”

南京大學目前實施的“三三制”人才培養模式，學生可以根據自己的興趣和志向自主選擇專業，可以通過跨院系專業準入（轉專業）和跨院系專業準出兩種途徑選擇自己喜歡并適合的專業學習。

具體而言，“專業準入準出標準”分為“專業準入標準”和“專業準出標準”兩部分，“專業準入標準”指學生在不同年級分流到某專業所要滿足的專業課程最低修讀標準，主要由學科平臺課程和部分專業核心課程構成（一般為學科平臺課程）。“專業準出標準”指學生從分流專業獲得學士學位的最低專業課程修讀標準，由所有學科平臺課程和專業核心課程組成。在達到“專業準出標準”的前提下，學生根據院系“多元培養分流機制”自主選擇個性化課程模塊，在完成所有應修學分并滿足其他畢業條件后準予畢業。“專業準入標準”一經核定，將作為分流到某專業的課程依據；“專業準出標準”一經核定，將作為審核學生獲得學位的依據。

現在，每年申請轉專業的同學80%以上都能夠順利進入新專業學習，實行“三三制”以來，許多同學并不急于在低年級申請轉專業，因為“專業準出”制度的實施，使得每個學生都可以通過選修相應的核心課程，從自己理想的專業畢業。南京大學幾乎所有專業的核心課程都向全校學生開放，使得這種跨專業準出成為可能。近年，我校就有畢業生因同時滿足了多個專業準出條件，而獲得了多個學位（校內雙學位）。