南京大學擁有國家基地班13個，位居全國高校第二。基地班覆蓋了南京大學8個一級學科國家重點學科中的7個，均設有碩、博士點，配備院士、*、杰青為主體的師資隊伍，并依托國家重點學科和重點實驗室教學科研優勢實施重點培養。基地班出國率30%以上，保研率60%以上。

重點專業
國家重點

漢語言文學、漢語國際教育、行政管理、新聞學社會學、社會工作、國際經濟與貿易、工商管理、英語、數學與應用、數學、信息與計算科學、物理學、化學、生物科學、環境工程天文學、軟件工程、建筑

國家品牌
歷史學、哲學、經濟學、法語、水文與水資源、工程大氣科學、臨床醫學