上海中醫(yī)藥大學優(yōu)勢專業(yè)有：
學校現(xiàn)有國家重點學科4個：中醫(yī)外科、中藥學、中醫(yī)內科及中醫(yī)骨傷科學，另有國家重點學科（培育）2個：中醫(yī)醫(yī)史文獻學、針灸推拿學；上海市重點學科9個。上海市高校E-研究院2個；上海市教委第五期重點學科5個。教育部高等學校重點學科（國家級重點學科）3個：中醫(yī)外科中藥學中醫(yī)內科上海市重點學科7個：中藥學（重中之重學科）、中醫(yī)內科學、中醫(yī)系統(tǒng)實驗方劑學、中醫(yī)醫(yī)史文獻學、針灸推拿學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)外科學

本科類

醫(yī)學

食品衛(wèi)生與營養(yǎng)學 | 中醫(yī)學 | 針灸推拿學 | 中西醫(yī)臨床醫(yī)學 | 藥學 | 中藥學 | 康復治療學 | 護理學

管理學

公共事業(yè)管理

專科類

生化與藥品

中藥制藥技術

醫(yī)藥衛(wèi)生

護理類(中外合作辦學) | 醫(yī)療美容技術