學院占地 1028 畝，建筑面積 19.75 萬平方米，分為兩個校區。老校區位于濟南市歷城區遙墻鎮，占地 420 畝，建筑面積 5. 05 萬 平方米 ，建有教學樓2 棟，辦公樓 1 棟，學生公寓樓 3 棟，大小學生職工餐 山東杏林科技職業學院廳 3 個，風雨運動場面積 10000 平方米 ，圖書館、閱覽室各 1 個，設有超市、儲蓄所、郵局、衛生室、洗衣房、理發室、開水房、鍋爐房（冬季供暖）等，生活設施一應俱全。

新校區位于濟南市東部大學城，依山傍泉，占地 608 畝，總建筑面積 14. 7 萬平方米 ，包括能容納萬名學生同時上課的教學樓1 棟（ 30000 平方米 ），多功能綜合實驗樓1 棟，圖書館1 座，高檔學生公寓5 棟，學生餐廳 1 棟，風雨運動場60000 平方米 。另有二期工程 6 棟學生公寓、一棟現代化綜合圖書樓約 50000 平方米，正在建設中，2006 年9 月正式投入使用。

為滿足各專業實驗實訓教學的需要，學院加大基礎教學設施投入，現有各類教學儀器設備總價值為 3000 萬元，其中適用于醫學類專業教學儀器設備總值 1600 萬元，同時還建有多功能的現代化實驗中心，擁有各類專業實驗室 56 個，品牌計算機 1000 臺，數字語音設備598 座，解剖標本室、解剖模型室、解剖多媒體主控室、顯微鏡實驗室、化學實驗室、生物化學實驗室、機能實驗室、病理室、臨床診斷實驗室、手術室、婦產科實驗室、口腔實驗室、口腔技工實驗室、護理實驗室、護理示教室、針灸推拿按摩實驗室、中藥實驗室等 30 個醫學實驗室，能充分滿足各學科各專業的實驗實訓教學需要。各專業實驗課開出率均達到 90 ％以上，醫學類實驗課開出率達 98 ％。學院目前藏書41 萬冊，學生運動場地 6 萬平方米 。

學院現有章丘市中醫院、淄博市第八人民醫院兩所附屬醫院，另有濟南市、章丘市等 3 所非直屬附屬醫院，另與全省 20 多所二級甲等以上綜合醫院簽訂教學與實習協議，并與 50 多家大中型企業簽訂實訓、實習就業基地協議，為學生技能培訓和實踐操作能力的提高提供了有力的保障。