南陽醫(yī)專的前身是創(chuàng)辦于1951年的南陽衛(wèi)校。2004年經(jīng)國家教育部批準升格為南陽醫(yī)學高等專科學校。2006年南陽市委市政府對南陽醫(yī)學教育資源進行整合，將南陽中醫(yī)藥學校連同張仲景國醫(yī)大學（理工學院國醫(yī)國藥系）并入南陽醫(yī)學高等專科學校，形成了中西醫(yī)結(jié)合、優(yōu)勢互補的辦學格局。目前，學校占地1316畝。校舍建筑面積47.8萬平方米，教學科研儀器設備總值1.05億元。館藏圖書150余萬冊，中外文期刊1520種。學校內(nèi)設20個黨政群團機構(gòu)，14個教學系(部、院)，6個教輔機構(gòu)。開設有臨床醫(yī)學、護理、醫(yī)學影像技術(shù)等18個專業(yè)，并與美國卡姆登學院、菲律賓伊密里歐學院合作辦學。學校有專任教師715人，其中：高級專業(yè)技術(shù)職務263人（正高60人），碩士以上學位325人，外國文教專家6人。5人被聘為高校碩士、博士生導師。

我校現(xiàn)有專門的科研機構(gòu)15個，其中市級以上研究機構(gòu)7個。并建有設備先進，功能配套，面積2300平方米的科研實驗中心。2012年學校被批準設立河南省博士后研發(fā)基地。艾滋病解剖標本填補國內(nèi)外空白，中藥標本館、人體生命科學館全國一流，仲景文化特藏館獨具特色,《國醫(yī)論壇》為國家級期刊，創(chuàng)辦的“中國解剖網(wǎng)”被中國解剖學會確定為專用網(wǎng)站。

學校還建有國家級示范性實訓基地1個，省級示范性實訓基地建設5個；省級特色專業(yè)5個，河南省教改試點專業(yè)2個，河南省高等學校專業(yè)綜合改革試點專業(yè)4個，中央財政支持建設專業(yè)2個；省級精品課程3門，河南省高等學校精品資源共享課程2門；省級教學團隊3個。先后承擔、完成了省級教育教改項目10項；國家授權(quán)專利201項；國家中醫(yī)藥管理局項目3項；國家自然科學基金項目1項；國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥科技專項中標項目1項。先后榮獲河南省高等教育教學成果特等獎1項；中華醫(yī)學科技二等獎1項；湖北省科技成果二等獎1項。2008年在教育部人才培養(yǎng)水平評估中被評為優(yōu)秀等次；2013年又順利通過第二輪人才培養(yǎng)工作評估，22項評估指標全部獲優(yōu)。被評為“河南省職業(yè)教育品牌示范學校”。

學校自主創(chuàng)建直屬附屬醫(yī)院3所，床位3100余張。第一附屬醫(yī)院為國家三級綜合醫(yī)院、全國百姓放心示范醫(yī)院和河南省全科醫(yī)師培訓基地、河南省住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地和全省愛嬰醫(yī)院，規(guī)模床位1800張，可獨立開展心臟冠狀動脈搭橋、心腦血管介入治療等高難醫(yī)療項目。第二附屬醫(yī)院為國家二級甲等中醫(yī)院和河南省示范性綜合實訓基地，規(guī)模床位500張，近期搬遷新址后，床位擴大到1000張。第三附屬醫(yī)院是以眼科和微創(chuàng)為特色的國家二級綜合醫(yī)院，規(guī)模床位300張。三所附屬醫(yī)院均建有較為完備的實訓場地和示教場所，承擔著我校全部臨床教學任務，為同學們實習、見習提供了保證。

學校先后榮獲“河南省文明單位”、“河南省職業(yè)教育攻堅先進單位”、“河南省示范性高職高專先進單位”、“河南省思想政治工作先進單位”、“河南省高校學生工作先進集體”等榮譽稱號40余項。