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根據上述職責，市教育局設8個職能科室。

（一）辦公室

協助局領導組織協調機關日常工作，負責文秘、檔案、信訪、調研、保密、保衛、督辦、會務、人大建議及政協提案辦理、教育行政審批、機關服務中心工作。

（二）人事科

負責機關和直屬單位的人事管理、機構編制工作；規劃、指導全市教師隊伍和教育行政干部隊伍建設工作；指導學校內部人事與分配制度改革工作及教師考核工作；組織協調教育行政管理人員培訓工作；指導師范類高校畢業生、畢業研究生的就業工作。

（三）計劃財務科（掛審計科牌子）

會同有關部門制定全市教育事業發展規劃及各類學校建設計劃。參與擬訂籌措教育經費、教育經費管理和教育收費的意見，監測教育經費投入、使用情況，編報市級教育經費年度預決算建議方案；管理直屬學校和局機關的財務和國有資產；參與全市義務教育經費保障機制改革；協調實施全市中小學校舍安全工程；指導學生資助工作；按規定權限負責機關和直屬單位的內部審計工作。

（四）基礎教育科

負責全市基礎教育工作（含學前教育）；推進教育教學改革，規范辦學行為；擬訂基礎教育評估標準和有關教學、教材建設及初中學業考試、高中段招生、高中學業水平考試的有關規定；擬訂各類學生平等接受義務教育、推進義務教育均衡發展的政策；指導全市特殊教育和民族教育工作；指導中小學、幼兒園的德育、校外教育和安全管理工作。

（五）職業教育與成人教育科

負責全市職業教育、成人教育和民辦教育的管理工作；指導全市中等職業教育學校布局調整，負責專業設置、招生、學籍管理和畢業證書驗印工作；負責市政府職業教育聯席會議辦公室的日常工作；指導鄉鎮職成教中心建設和城市社區教育工作；負責普通高校駐棗函授站的管理；協調指導民辦學校布局調整、招生和管理工作。

（六）體育衛生與藝術教育科

指導全市學校體育、衛生與健康教育、藝術和國防教育工作，擬訂相關政策并組織實施；制定相關專業的教材建設、師資培養和科研工作；負責全市學生體質健康調查和檢測工作，擬訂改善學生體質的相關政策；負責組織開展學生體育競賽和藝術展演活動；擬訂全市體育升學考試方案并指導實施；協調指導全市學校軍訓工作。

（七）思想政治工作與宣傳科

指導全市各級各類學校的思想政治工作、德育工作和精神文明建設。指導全市教師職業道德建設及考核工作；負責全市教育系統宣傳信息工作和普法宣傳教育工作。

（八）師范師訓科

負責全市中小學（含幼兒園）教師學歷培訓、校長崗位培訓和繼續教育工作；協調指導中等師范教育和教師進修學校的教學管理工作；負責語言文字工作；負責教師資格認定工作。

市政府教育督導室設在市教育局，由教育局代管。

離退休干部科。負責機關離退休人員的管理服務工作，指導直屬單位離退休人員的管理服務工作。