蒙醫學專業培養具備蒙醫學基礎理論和醫療技能以及一定的現代醫學知識，能在本專業和蒙西醫結合方面的醫療、教學、科研等領域從事實際工作的蒙醫學高級專門人才。

蒙醫學包括基礎理論、蒙藥與蒙藥方劑、臨床各科等幾大學科。蒙醫基礎理論主要研究人體生理、病理、疾病的診斷和治療原則以及治療方法等，對臨床各科具有指導意義的一門學科。蒙醫學理論來源于臨床實踐，又反過來指導臨床實踐，并在實踐中不斷得到充實和發展。

主干課程,蒙醫基礎理論、蒙醫診斷學、蒙藥學、蒙醫方劑學、(四部醫典)導讀、蒙醫療學、蒙醫溫病學、蒙醫內科學、人體解剖學、生理學、診斷學、內科學、中醫學。

蒙醫學專業實踐教學,主要實踐性教學環節：包括采藥認藥、制藥實習、臨床見習、畢業實習等，一般安排56周。

蒙醫學專業開設學院,內蒙古醫科大學、內蒙古民族大學