物理：
是南京大學優勢專業之一，其主要教學特色在于：
1. 強化素質教育，學校規定每個學生都必須完成14個學分的文化素質教育課程，其中包括4個學分的藝術課程、8個學分的人文社會科學類文化素質課程、2 個學分的自選文化素質課程。
2. 實行課堂教學、學術活動、科學研究為一體的“三元結構”教學模式，對學生進行全面素質的培養。組織學生早期參加學術活動和科學研究，低年級時做課程論文和設計實驗，開放實驗室，優秀的三年級學生就可進入科研實驗室參加研究工作。
數學：
以歷史悠久、實力雄厚、治學嚴謹而著稱，自建系以來，其學術影響一直處于國內領先地位，并具有一定的國際聲譽。現為國家一級重點學科(基礎數學)、國家理科人才培養基地。設有數學與應用數學(教育部第一類特色專業建設點)、信息與計算科學、統計學3個本科專業。該系采用“基地班”等分流培養模式，對學生實施因材施教。從用人單位的需求著手，探索出了一條名校與名企攜手，“送出去、請進來”的改革之路，如與華為 3COM 公司合作，成立了南京大學數學系——華為3COM網絡學院，對學生進行華為 3COM 的認證培訓；與人民銀行、移動通信、平安保險等公司的合作，都非常成功。
生物科學：
該專業依托南京大學生命科學學院及化學化工學院的教學師資及科研力量。主要面向食品保健行業、食品研發機構和相關生產企業、學校、賓館等公共服務機構輸送營養學基礎研究與應用高級人才，滿足社會需求。
歷史：
學科分為兩個本科專業方向——歷史和考古學，南京大學歷史學學科在同學科門類中占有極高的地位，其獨特的發掘理論，獨特的整理方法，獨特的邏輯思維，都使人們望而卻步。
現在則通過不同的方式組織學生參加田野實習，而不再是單純地培養博物館專業人才。中國大學專業介紹之計算機科學與技術 中國大學專業介紹之經濟類和管理類 中國大學專業介紹之農學醫學類 中國就業前景最好的二本院校特色專業介紹 中國大學華而不實專業介紹 中國大學大類專業介紹（簡介二） 中國大學大類專業介紹（簡介一) 就業最不樂觀的八大專業介紹 中國大學專業介紹：溫州醫學院眼視光學專業 大學理科主要學科和專業介紹